2つの値を算術的に比較し、フラグをセットします。算術的とは、16ビットの2の補数表現を用いた符号付整数として扱うという意味です。すなわち、#7FFF と #8000との比較では、#7FFFの方が大きくなります（32767 > -32768）。
CPA gr,adr[,xr]
gr : 汎用レジスタ名（GR0～GR7）
adr : 定数またはラベル
xr : 指標（インデックス）レジスタ名（GR1～GR7）
カギ括弧 [ ] 内はオプション（省略可能）です。
CPA GRn,LABEL
GRnの内容とLABELが指しているアドレスの内容を算術的に比較して、SZラグをセットする。Oフラグは常に0であり、GRnの内容は変化しない。
CPA GRn,=m
GRnの内容と、定数mを算術的に比較する。（COMETⅡの機械語には無いことに注意。機械語は上のラベルの場合と同じになる。）
CPA GRn,LABEL,GRm
GRnの内容と、LABELが指しているアドレスにGRmの値を加えたアドレスの内容を算術的に比較する。
例えば、CPA GR0, A の場合、基本的には、GR0の内容から A の指しているメモリの内容を減算し、その結果でフラグをセットし、これを GR0 に戻さない操作に近い動きをしますが、教科書p38下の例のように、オーバーフローが発生するような数値の場合には、異なる動作をします。
CPAにも、他の演算と同様の1語命令があります。